חוקר מגייס את Codex ו-ChatGPT לצוד מולקולות אנטי-מיקרוביאליות חדשות

המעבדה של César de la Fuente מיישמת את Codex ו-ChatGPT של OpenAI כדי לסרוק גנומים של יצורים חיים ונכחדים אחר מועמדים אנטי-מיקרוביאליים חדשים — מולקולות שיכולות להילחם בזיהומים עמידים לתרופות, אחד האיומים הרפואיים הדוחקים ביותר. OpenAI תיעדה את העבודה כמקרה בוחן ל-AI יישומי בגילוי ביו-רפואי.

מבחינה מכניקה, הגישה משתמשת ב-LLMs לכריית מערכי נתונים גנומיים עצומים, כולל רצפים מאורגניזמים נכחדים, אחר מועמדים של פפטידים ומולקולות בעלי תכונות אנטי-מיקרוביאליות. Codex מטפל בצינור החישובי בעוד ChatGPT מסייע בהיסק על פני נתונים ביולוגיים, ומכווץ מרחב חיפוש שהיה לוקח לחוקרים אנושיים שנים לחצות ידנית.

היישום עומד בניגוד חד לחדשות ה-AI-ביו האפלות יותר של השבוע: Anthropic חשפה שחסמה משתמשים שניסו להשתמש ב-Claude לפיתוח נשק ביולוגי. העבודה של de la Fuente ממחישה את מתח השימוש-הכפול שבלב ה-AI-בביולוגיה — אותן יכולות שיכולות להאיץ גילוי אנטיביוטיקה עלולות, בשימוש לרעה, לסייע בתכנון פתוגנים. ההחלטה של OpenAI להאיר את היישום הבונה היא בחלקה משקל-נגד נרטיבי.

מבחינה תחרותית, AI-למדע הופך לזירת יוקרה. Google DeepMind חשפה את AlphaGenome Atlas השבוע (שמנקד כל שינוי אפשרי של אות DNA), ו-OpenAI טענה לאחרונה לפריצת דרך מתמטית ב-Navier-Stokes. הדגמת השפעה ביו-רפואית אמיתית עוזרת לחברות ה-AI להצדיק את הוצאות כוח המחשוב שלהן ואת עמדות הבטיחות שלהן. הסייג: מולקולות מועמדות רחוקות מרחק רב מתרופות מאומתות — שווה לעקוב אחר אישור במעבדה רטובה ואם מועמדים כלשהם של de la Fuente יתקדמו לעבר בדיקות קליניות.